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L'objectif de la Plateforme d'Analyse Protéomique de Paris Sud Ouest (PAPPSO) est de mettre à disposition des équipes qui s'adressent à elle un équipement, une compétence scientifique et un savoir-faire adaptés aux questions posées, depuis les plus simples (identification de protéines provenant d'un organisme entièrement séquencé) jusqu'aux plus complexes (quantification des variations d'abondance, dynamique des modifications post-traductionnelles,…).

La complémentarité des compétences et équipements des deux plateaux de PAPPSO lui permet de proposer des analyses basées sur la séparation des protéines ou des peptides aussi bien que sur des techniques de type “shotgun”, avec ou sans marquage isotopique.

Parallèlement aux analyses menées dans le cadre des collaborations, PAPPSO réalise une veille technologique dans le domaine de la protéomique, et développe des outils d'informatique, de bioinformatique et de statistiques. L'ensemble de ces développements permet à PAPPSO de proposer les analyses de protéomique les plus modernes, et une exploitation approfondie des résultats. L’ accompagnement intensif des utilisateurs, depuis la conception du dispositif expérimental jusqu'à l'exploitation statistique et bioinformatique des données, constitue l'une des caractéristiques de PAPPSO. PAPPSO réalise également des formations sur les outils qu'elle développe.

La direction et l'ensemble du personnel de la plateforme souhaitent poursuivre sur la voie de l’amélioration du service rendu aux utilisateurs et s’engagent à tout mettre en œuvre pour satisfaire et si possible anticiper les exigences de l’ensemble des parties intéressées. Ils s’engagent de même à répondre aux exigences réglementaires.

La direction veillera à:

  • maintenir une recherche permanente de l’efficacité des processus (tous les processus);
  • maintenir un parc instrumental en état de bon fonctionnement et à le renouveler pour disposer des appareils les plus performants (PS1 et PS6);
  • maintenir à jour l'expertise du personnel en les faisant participer aux formations et colloques appropriés et en favorisant l'animation scientifique au sein de la plateforme (PS1 et PS5);
  • produire des résultats de haute qualité dans les meilleurs délais (tous les processus);
  • assurer l’ouverture de la plateforme en veillant à consacrer une proportion importante des analyses aux laboratoires extérieurs aux unités d’adossement (PS1);
  • réaliser une veille technologique et des développements appropriés, tant au niveau des expériences que du traitement et de l'analyse des données (PS3);

Les objectifs que nous nous sommes fixés feront l'objet d'une évaluation et d'une reconsidération en 2020, afin de déployer de nouveaux axes d'amélioration de nos prestations.

Michel Zivy, Responsable scientifique de la plateforme PAPPSO

Véronique Monnet, Co-responsable scientifique de la plateforme PAPPSO