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PAPPSO est membre du Groupement de Recherche sur les modifications post traductionnelles chez les bactéries. GDR

PAPPSO est partenaire dans projet européen CHASSY, vidéo dédié à l’utilisation de levures pour la production de composants à haute valeur ajoutée pour les secteurs de la cosmétique, de la nutrition, de la chimie et de la pharmacie site web CHASSY, site INRA

Les journées du Protéome Vert 2019 se tiendront l’après-midi du lundi 3 et le matin du mardi 4 juin à AgroParisTech.

Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.2.31 :

• nouvelle possibilité de sélection de la précision de masse en utilisant la résolution
• bug à l’export des fichiers FASTA corrigé

Corrections de problèmes d’affichage dans la version Windows :

Voici les changements depuis la dernière version annoncée 0.2.28 :

• de nouveaux exports au format FASTA sont disponibles. On peut exporter toutes les protéines valides et groupées, ou seulement une protéine par sous groupe, ou seulement une protéine par groupe.
• dans les exports ODS/TSV, un nouveau tableau dédié à la peptidomique est disponible. Il affiche le nombre de spectres identifiés par peptide et par échantillon, ce qui permet de les comparer facilement.
• une nouvelle boite de dialogue pour configurer les analyses de quantification avec MassChroQ est dispobible. On peut choisir facilement tous les paramètres importants comme l’extraction des XICs, la détection des pics, l’alignement… et aussi vérifier l’emplacement des fichiers MS runs ou choisir le nom des fichiers de sortie.
• une légende est affichée dans le graphique représentant les massifs isotopique pour reconnaitre le massif mesuré réellement et le massif théorique, calculé avec la formule chimique du peptide.

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