La plateforme dispose de 2 systèmes chromatographiques pour la séparation des protéines/peptides en amont de l’analyse en LC-MS/MS:
- Low pressure system (FPLC ÄKTA Purifier, Amersham)
- Low pressure system (HPLC Prominence, Shimadzu)
Elles sont principalement utilisées pour la séparation des peptides phosphorylés par chromatographie d’échange de cations (SCX).