• TimsTOF Pro

    TimsTOF Pro

    Le spectromètre de masse TimsTOF Pro (Bruker) est doté d’un module de mobilité ionique (Tims) qui permet d’accéder à une 4ème dimension : la mobilité ionique (les trois dimensions classiquement obtenues étant le temps de rétention (RT), la masse des ions (m/z) et l’intensité des ions). Cette mobilité ionique permet par exemple, de différencier des peptides isobares portant des modifications post-traductionnelles. La très grande vitesse d’acquisition et la sensibilité de ce spectromètre de masse vont permettre de réduire les temps d’injection et les quantités d’échantillons analysées (à partir de 10 ng d’échantillon), tout en maintenant un très haut niveau d’identification et de quantification des protéines dans des échantillons complexes. L’achat de ce spectromètre de masse s’est accompagné d’un investissement dans un logiciel de traitement des données de mobilité ionique : PEAKS (Bioinformatics Solutions Inc.). PAPPSO implémente également cette mobilité ionique dans ses outils.

  • Orbitrap Fusion Lumos Tribrid

    Orbitrap Fusion Lumos Tribrid

    La plate forme PAPPSO a fait l’acquisition, en décembre 2015, du premier spectromètre de masse Orbitrap Fusion Lumos tribrid installé en France. Ce spectromètre de masse de dernière génération est doté de trois analyseurs (quadrupole, trappe, orbitrap), de trois modes de fragmentation (CID, HCD, ETD) et dispose ainsi d’une très grande versatilité d’analyse. Le mode de fragmentation ETD HD (High Definition ETD), unique à la gamme Lumos, permet d’augmenter la couverture des ions issus de fragmentation ETD.

  • Q Exactive Plus

    Q Exactive Plus

    Cet appareil offre une grande vitesse d’acquisition à haute résolution (MS et MS/MS). Il est utilisé dans l’analyse de mélanges protéiques très complexes (identification et quantification) ou pour la détermination de modifications post-traductionnelles.

  • Systeme HPLC pour préfractionnement

    Systeme HPLC pour préfractionnement

    La plateforme dispose de 2 systèmes chromatographiques pour la séparation des protéines/peptides en amont de l’analyse en LC-MS/MS:

    • Low pressure system (FPLC ÄKTA Purifier, Amersham)

    • Low pressure system (HPLC Prominence, Shimadzu)

    Elles sont principalement utilisées pour la séparation des peptides phosphorylés par chromatographie d’échange de cations (SCX).