Devoirs de la plateforme PAPPSO

  • Fournir les recommandations pour la préparation des échantillons et des informations sur le fonctionnement des appareils.
  • Informer les utilisateurs sur le traitement des échantillons.
  • Mobiliser l’ensemble des moyens adéquats pour la réalisation des expériences et l’analyse des résultats (équipement, fonctionnement, informatique).
  • Lorsque des bases de données privées sont nécessaires à l’analyse, s’engager à les utiliser uniquement sur le serveur interne de PAPPSO via un accès restreint et sécurisé.
  • Garantir la confidentialité des résultats.
  • Lorsque nécessaire, informer de manière circonstanciée les utilisateurs sur les problèmes liés à une analyse.
  • Rendre un rapport avec les résultats aux utilisateurs.
  • Assurer la sauvegarde informatique des résultats au minimum 2 ans (à compter du rendu des résultats) et disponibles sur demande.
  • Encourager et accompagner la diffusion des données dans les entrepôts dédiés pour les partager avec la communauté scientifique en lien avec la politique de science ouverte.

A noter que les analyses de spectrométrie de masse sont destructives. Aucun échantillon, une fois analysé, ne pourra être restitué. La conservation des reliquats éventuels d’échantillon n’est pas assurée.

Devoirs des utilisateurs envers la plateforme PAPPSO

  • Prendre contact avec les ingénieurs de la plateforme.
  • Donner des informations sur les objectifs de l’expérience via un formulaire fourni après le premier contact.
  • Fournir les échantillons préparés selon les recommandations de la plateforme pour les analyses LC-MS/MS.
  • Donner accès aux bases de données nécessaires à l’identification des protéines lorsque celles-ci ne sont pas accessibles sur internet.
  • Participer financièrement aux coûts des analyses en fonction de la tarification établie et disponible ici.
  • Diffuser les données obtenues via leur dépôt dans des entrepôts dédiés.

Valorisation des résultats et signature (articles et communications)

La valorisation des résultats doit suivre les règles normales de signature et de remerciements.

  • Le demandeur s’engage à faire co-signer les personnes de la plateforme ayant mené les analyses si les résultats produits par la plateforme sont essentiels à l’article ou à la communication.
  • Si les résultats produits par la plateforme ne sont pas essentiels à l’article ou à la communication, remercier la plateforme pour l’équipement mis à disposition et/ou les personnes de la plateforme pour leur participation aux analyses.

Dans les deux cas, une phrase de remerciement spécifique pour PAPPSO est nécessaire comme suit :

Proteomics analyses were performed on the PAPPSO facility (https://doi.org/10.15454/1.5572393176364355E12) which is supported by Paris Saclay University (https://www.universite-paris-saclay.fr/en), INRAE (http://www.inrae.fr), CNRS (http://www.cnrs.fr), AgroParisTech (https://www.agroparistech.fr/en), the Ile-de-France regional council (https://www.iledefrance.fr/education-recherche), IBiSA (https://www.ibisa.net), Saclay Plant Sciences-SPS (ANR-17-EUR-0007), and Plant2Pro® (#24 CARN 0024-01).

  • Informer la plateforme des communications à des congrès de résultats obtenus en partie grâce à PAPPSO.