News

MassChroQ: new release version 2.0.1

Mon, 06 May 2013 14:30:05 +0200

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MassChroQ: new release version 2.0

Wed, 03 Oct 2012 14:30:05 +0200

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X!TandemPipeline: new release version 3.3.0

Thu, 07 Jun 2012 13:39:23 +0100

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Liens Utiles

• Le réseau MassProt' INRA : huit plateaux de spectrométrie de masse en France
• Le Réseau Univer Sud Paris Proteome

Plateformes protéomiques INRA

• Service de spectrométrie de masse pour la protéomique de Tours
• PLate-forme de spectrométrie de masse de Nantes
• Plate-forme de protéomique de Montpellier (PPM)
• Plateau de protéomique de Theix
• Plate-forme de spectrométrie de masse de Rennes

Autres plateformes

• IPBS Toulouse
• IFR : IBSM Marseille
• plateforme protéomique de Lille
• LSMBO, Strasbourg
• DCMR, polytechnique, Palaiseau
• ICSN, Gif sur Yvette

Modifications post-traductionnelles

• Deltamass
• PhosphoDB Phosphoelm
• BiowebPasteur
• Findmod
• Glycomod
• Scansite
• NetPhos Server
• PlantsP
• Resid database
• The Protein Domain database : http://protein.toulouse.inra.fr/prodom/current/html/home.php

Identification de protéine

• Mascot
• Protein Prospector
• Peptident
• Aldente
• prowl (Profound, X!tandem,peptide map)
• MassSearch
• X-tandem
• Phenyx
• Lutefisk
• pepMAPPER
• Sherpa (MAc uniquement)
• De novo tutorial

Spectrométrie de masse

• sci.techniques.mass-spec :http://www.chemistry.gatech.edu/stms

Forum de discussions autour de domaines divers touchant à la spectromètrie de masse

• Now (anciennement Base Peak) : http://www.spectroscopynow.com
• History of Mass Spectrometry : http://masspec.scripps.edu/hist.html
• Tutorial ESI : ionsource

Logiciels de calcul de masse

• Peptide Properties Calculator
• Outil de calcul de masse du NIST
• Gpmaw
• paws
• logiciel de calcul de massif isotopique : ISOTOPIDENT
• The Tools Menu

Serveurs biologiques

• ExPASy Molecular Biology Server
• The National Center for Biotechnology Information : NCBI
• Protein Data Bank PDB
• The Association of Biomolecular Resource Facilities : ABRF
• EMBL
• Matrix science

Sociétés et organisations

• American Society for Mass Spectrometry
• Association of Biomolecular Resource Facilities
• The Electrophoresis Society
• The Proteome Society
• ASBMB
• Proteome Sciences
• Proteomic world
• Mass Spectrometry and Biotechnology Resource
• Mass Spectrometry Web Address
• ProteinScience.com
• NCB
• European Bioinformatics Institute
• Swiss Institute of Bioinformatics

Publications en protéomiques

• guidelines de MCP
• Proteomic Standards Initiative / MIAPE
• Proteomics