La Plateforme d’Analyse Protéomique de Paris Sud Ouest (PAPPSO) met à disposition un équipement, une compétence scientifique et un savoir-faire adaptés aux questions de protéomique posées par les équipes qui s’adressent à elle, depuis les plus simples (identification de protéines provenant d’un organisme entièrement séquencé) jusqu’aux plus complexes (quantification des variations, dynamique des modifications post-traductionnelles,…), dans le cadre de collaborations et de prestations.

PAPPSO réunit deux plateaux techniques complémentaires. L’un, à Jouy, est spécialisé dans les procaryotes et l’autre, au Moulon (Gif-sur-Yvette), dans la biologie végétale. La complémentarité de leurs compétences et équipements permet à PAPPSO de proposer la réalisation d’analyses basées sur la séparation des protéines ou des peptides aussi bien que sur des techniques de type “shotgun”, avec ou sans marquage isotopique.

PAPPSO s’est spécialisée dans le haut débit (analyse quantitative de cohortes de grande taille) et dans l’analyse d’échantillons très complexes (métaprotéomique). Elle développe les outils de bioinformatique et d’analyse de données qui permettent de traiter ce type d’expérience, et accompagne les utilisateurs dans l’interprétation de leurs données.

PAPPSO est ouverte aux collaborations nationales et internationales et a été labellisée comme telle en 2009 (label IBiSa).

PAPPSO remercie l’ensemble des partenaires qui la soutiennent financièrement.